从下图中可以看出[1]，粪便收集器中不同位置取出的局部粪便样品和整体匀浆后的粪便样本（绿色）在PCA得分图上有较为明显的分布差异，且这种差异在不同个体之间是不一致的。相比于代谢物组，不同位置获得的菌群测序结果却差异不明显，为了方便存储，显然不可能把所有收集到的新鲜粪便冻存。因此，临床上冻存收集的新鲜粪便之前，需用无菌棒将样品混匀。

图1. 粪便不同部位代谢轮廓PCA图