文献解读
Nature | 新型甲基半胱胺结合型胆汁酸:FXR拮抗喜迎新将
在脊椎动物宿主与其肠道共生菌群间错综复杂的代谢互动中,胆汁酸(BA)的生成与调控途径在其中尤为突出。BA不仅是FXR(法尼醇X受体farnesoid X receptor,属于核受体超家族,作一种BA稳态、脂质稳态、葡萄糖稳态和氨基酸代谢的肠肝调节剂)的重要配体,还能在BAAT酶的催化下与牛磺酸或氨基酸巧妙结合,形成稳定的共轭形式。这些共轭胆汁酸随后经由胆汁系统输至肠道。随后肠道微生物代谢这些共轭胆汁酸,使其去共轭并重新释放出游离BA。这一过程不仅促进了BA在宿主体内的再吸收和循环利用,还使得游离BA能够以其强大的FXR激动活性,对BA的合成进行精细的负向调控。已证实大部分已知胆汁酸是FXR激动剂,只有少数几种BA,如石胆酸(Lithocholic acid),Tauro-α-muricholic acid (T-α-MCA)等具有FXR拮抗功能。
是否还存在新型的BA类的FXR拮抗剂能够作为正向调节因子影响BA的合成?
近期,美国康奈尔大学的研究团队在Nature上发表了题为“Host metabolism balances microbial regulation of bile acid signalling”的研究论文,发现了一种在肠道中含量丰富的新型胆汁酸:甲基半胱胺结合型胆汁酸(BA-MCY),或许正是科学家一直寻找的FXR新型拮抗剂。
技术路线图
BA-MCY:甲基半胱胺修饰型胆汁酸
BAAT:1型酰基辅酶A硫酯酶,在宿主肝脏中催化胆汁酸与牛磺酸及氨基酸的结合
Pantetheine:泛酰硫氢乙胺,半胱胺的前体物质,可由辅酶A生成
VENN1:泛酰巯基乙胺酶,可将泛酰巯基乙胺水解为半胱胺和泛酸
BSH:胆盐水解酶,一类广泛存在于哺乳动物肠道菌群中的酶,可水解氨基酸结合型胆汁酸,释放出游离胆汁酸
FXR:法尼醇X受体,是脊椎动物中胆汁酸的主要内源性靶标之一,对胆汁酸的产生具有负调节作用
研究结果
1. BA-MCY:一种肠道菌群衍生的新型胆汁酸
为鉴定出与肠道菌群相关的新型胆汁酸,作者选择了对无特定病原体小鼠(SPF)和无菌小鼠(对照)的血清进行代谢组学检测。首先通过严格的标准筛选出数百种存在显著差异的菌群衍生代谢物,随后基于MS2数据和分子式过滤保留BA及其衍生物,再利用网络分析将这些物质分为3类:其中两类是已知的BA-牛磺酸结合物(牛磺胆酸)和游离型BA,而第三个簇则是一类未被注释的新型BA衍生物。进一步的谱图分析和合成标品鉴定表明,这是一种甲基半胱胺结合型的胆汁酸(及其氧化衍生物),被命名为BA-MCY,其含量在无菌鼠的血清和粪便中显著下调,但并未完全消失。随后的粪菌移植FMT实验进一步验证了BA-MCY的肠道菌群依赖性。
BAs的MCY结合物鉴定
2. BA-MCY的合成起源
关于BA-MCY的来源,作者提出了两种假设:一种是“结合”,即MCY与BA结合生成BA-MCY,一种是“分解”,即BA-牛磺酸被还原成BC-MCY。为此设计了稳定同位素标记实验以追踪MCY中S原子的来源。分别给小鼠饲喂两种标记物:氘代牛磺酸(taurine-d4)和氘代半胱氨酸(半胱胺的前体,l-cysteine-d2),然后观察BA-MCY的标记情况。结果发现标记牛磺酸的情况下,BA-牛磺酸被标记,但BA-MCY未被标记;而在标记半胱氨酸的情况下,BA-MCY被标记,这些结果表明了BA-MCY中的硫源是半胱胺(而非牛磺酸),即MCY与BA结合生成了BA-MCY。
那么这种结合反应是由菌群还是宿主介导的呢?从上文可知,尽管BA-MCY的丰度高度依赖于肠道菌群,但在无菌鼠中它们的生成并未完全消失,因此结合反应本身并不需要菌群。此外,已知在动物的肝脏中,BA与牛磺酸及氨基酸的结合由宿主的BAAT(一种1型酰基辅酶A硫酯酶)催化,但在BAAT缺失(Baat-/-)小鼠中,游离BA和BA-MCY的水平均显著增加。这些结果表明,BA-MCY由宿主介导生成,但它与BA-牛磺酸的形成原理并不相同。
最后作者探讨了BA-MCY的生成部位。通过比较小鼠不同器官的代谢水平,发现肠道组织中的BA-MCY丰度远高于肝脏组织,且BA-MCY与其氧化产物(BA-MCYO)的比例也有类似的规律,这表明BA-MCY是由游离BA在肠道中被重吸收后生成的。
BA-MCY的微生物依赖性和生物合成
3. BA–MCY的具体合成途径
在生物体内,半胱氨酸在形成半胱胺的过程中会经历辅酶A(CoA)、泛酰硫氢乙胺(pantetheine)等中间体,考虑到BA-MCY在肠道组织中浓度最高,作者想到了一种同样在肠道组织中高表达的酶:VNN1,一种泛酰巯基乙胺酶,负责在辅酶A的回收过程中将泛酰巯基乙胺水解为半胱胺和泛酸。在体外实验中,作者发现重组VNN1不仅可以水解泛酰巯基乙胺,也具有水解胆酸–泛酰巯基乙胺(CA–pant)的能力,且对两种底物的分解效率相当;重要的是,同时也在Baat-/-小鼠中测到了CA–pant的重排形式:胆酸–半胱酰胺(CA–CY),而这也是BA–MCY的前体。
为了验证VNN1是否通过这种方式在体内促进BA–MCY的生物合成,作者比较了野生型(WT)和VNN1缺失(Vnn1-/-)小鼠不同组织中的胆汁酸谱,发现VNN1缺失使小鼠小肠、肝脏和血清中的BA–MCY水平显著降低;此外Vnn1-/-小鼠的小肠和粪便中存在CA–CY和CA–pant的积累,而肝脏和血清中未检出,同样地,WT小鼠中也未检测到这些前体物质。上述结果表明,BA-泛酰巯基乙胺是肠道中BA–MCY生物合成的直接前体,该过程需要宿主VNN1酶的参与。
4. BA–MCY的分解代谢途径
我们知道,牛磺酸和甘氨酸结合型BA在肠道中被菌群的胆盐水解酶(BSH)高效去共轭化,生成游离BA,因此作者猜测BA–MCY可能也存在类似的分解代谢机制,并进行了稳定同位素示踪研究。首先对SPF小鼠和无菌小鼠补充鹅去氧胆酸–d5–MCY(CDCA–d5–MCY),对粪便和肝脏样本进行检测,结果发现无菌小鼠中未检测到带有标记的CDCA及游离BA,说明CDCA–MCY的去共轭化依赖于肠道菌群;此外抗生素处理的SPF小鼠中CDCA–d5–MCY的去共轭化显著降低,进一步证明了这一结论。接下来用删除了编码BSH基因的卵形拟杆菌突变株定植无菌小鼠,发现CDCA–d5–MCY未去共轭化,而是完全转化为了氧化产物,证实了BSH对BA–MCY的分解代谢关重要。
这些结果表明,与BA-牛磺酸的代谢类似,BA–MCY的去共轭化也需要肠道菌群的BSH参与。而在缺乏肠道菌群的情况下,BA–MCY则会被宿主代谢为相应的氧化衍生物(即BA–MCYO和BA–MCYO2)。
BA-MCY的宿主依赖性合成途径以及微生物分解代谢
5. BA–MCY的作用:FXR拮抗剂
FXR(法尼醇X受体)是脊椎动物中胆汁酸的主要内源性靶标之一,对胆汁酸的产生具有负调节作用,已知部分游离胆汁酸(如CDCA、CA和DCA)以及氨基酸结合型CA是强效的FXR激动剂,能够激活FXR并调节相关基因的表达。为了检测BA–MCY是否具有潜在的FXR激动剂或拮抗剂活性,作者选择了四种衍生物(CA–MCY、CA–MCYO、βMCA–MCY和CDCA–MCY)进行激动剂和拮抗剂活性检测。结果表明,CDCA–MCY、CA–MCY和βMCA–MCY均显示出强烈的FXR拮抗剂活性,其中CDCA–MCY还可以抑制由其他胆汁酸激活的FXR,而CA–MCYO无活性,表明硫的氧化消除了拮抗剂活性。
BA-MCY是FXR拮抗剂
随后聚焦拮抗活性测试中效力最高的CDCA–MCY,通过关键酶的基因表达量以及胆汁酸含量等方面,在小鼠体内验证了其拮抗剂活性。此外,在野生型(WT)小鼠和FXR缺陷(Nr1h4-/-)小鼠中的研究表明,CDCA–MCY补充增加胆汁酸生物合成的作用依赖于FXR。最后研究还表明,在高胆固醇饮食喂养的小鼠中,CDCA–MCY补充可以显著改善肝脏中的脂质积累,意味着BA–MCY在胆汁酸代谢和FXR信号传导中可能具有重要的生理和病理作用。
BA-MCY在体内调节BA生物合成的模式
研究结论
本研究通过代谢组学分析鉴定出一种新型胆汁酸:甲基半胱胺结合型胆汁酸(BA-MCY),这类胆汁酸在肠道中含量丰富,且它的合成依赖于宿主VNN1。在生物学功能方面,BA-MCY为FXR的强效拮抗剂,在体内促进胆汁酸生物合成基因的表达。
参考文献
Won TH, Arifuzzaman M, Parkhurst CN, et al. Host metabolism balances microbial regulation of bile acid signalling. Nature. 2025
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