文献解读
众多顶刊齐荟萃，2024高分客户案例连连看！
2024年不知不觉已过大半，在上半年中麦特绘谱携手众多合作伙伴发表了100＋篇优秀文章，见证了众多顶尖期刊如Cell, Cancer Cell, Signal Transduction and Targeted Therapy, Immunity, Cell Metabolism, Nature Metabolism等汇聚一堂的盛况，展现了科研团队在各个研究领域的最新进展，也标志着科研创新能力的显著提升。
在此，小编精心为为各位科研学者整理了麦特绘谱合作伙伴PICK的高分期刊以及疾病研究热点话题，涵盖肿瘤与癌症、消化系统类疾病、代谢性疾病、心血管疾病、免疫疾病等多个研究领域，助力各位2024年科研成果更上一层楼！
一、肿瘤与癌症
01. Identification of hypoxic macrophages inglioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
发表期刊：Cancer cell，2024IF=48.8
合作项目：蛋白质组学和能量代谢检测服务
合作单位：陆军军医大学
发表时间：2024.04
研究简介：在胶质母细胞瘤中，显著的坏死区域伴随大量不稳定的微血管，坏死区域周围的环境信号使巨噬细胞极化到缺氧状态，进一步增强血管的高通透性，通过绘制胶质母细胞瘤TAM空间图谱，强调了脑胶质瘤中Mo-TAM的多样性和空间微环境引导的Mo-TAM重编程，鉴定出缺氧微环境内Hypoxia-TAM新功能亚群，指出了针对Hypoxia-TAM的潜在治疗方法，为提高肿瘤治疗药物灌注和疗效提供新策略。
02. Branched-chain amino acid transaminase 1 confers EGFRTKI resistance through epigenetic glycolytic activation
发表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy，2024IF=40.8
合作项目：代谢流（13C-leucine＋13C-KIC）检测服务
合作单位：上海药物研究所
发表时间：2024.08
研究简介：用高通量蛋白质组学分析，对建立的TKI耐药肿瘤模型进行了全面研究，发现与亲本TKI敏感的NSCLC肿瘤相比，在奥希替尼和ASK120067耐药的肿瘤中，支链氨基酸转氨酶1（BCAT1）的表达显著上调。进一步的研究表明，通过遗传敲除或药物抑制BCAT1，可以抑制耐药细胞的生长，并部分恢复肿瘤细胞对EGFR TKIs的敏感性。机制上，耐药细胞中BCAT1的上调重编程了支链氨基酸（BCAA）代谢，促进了依赖于α-酮戊二酸（α-KG）的组蛋白H3第27位赖氨酸（H3K27）的去甲基化，进而转录解除了糖酵解相关基因的抑制，增强了糖酵解并促进了肿瘤进展。此外，研究还鉴定出了一种新型BCAT1抑制剂WQQ-345，该抑制剂在体内外均对高表达BCAT1的TKI耐药肺癌具有抗肿瘤活性。强调了BCAT1在介导第三代EGFR-TKI耐药中的关键作用，并揭示了其通过表观遗传激活机制促进肿瘤进展的分子机制。
03. BCAA-producing Clostridium symbiosum promotes colorectal tumorigenesis through the modulation of host cholesterol metabolism
发表期刊：Cell Host & Microbe，2024IF=20.6
合作项目：Q300全定量检测服务
合作单位：上海仁济医院
发表时间：2024.08
研究简介：共生梭菌在结直肠癌患者的肿瘤组织中选择性富集，并与结直肠腺瘤复发率相关，在多种小鼠模型中印证了共生菌的致瘤作用。单细胞转录组分析和功能分析表明，C. symbiosum促进结肠癌干细胞的增殖并增强癌症的干性。通过靶向代谢组学分析，C. symbiosum通过产生支链氨基酸来增强细胞胆固醇合成，激活Sonic hedgehog信号传导。低BCAA摄入或他汀类药物阻断胆固醇合成可在体内和体外部分阻断共生菌诱导的细胞增殖。
04. TRIM65/NF2/YAP1 Signaling Coordinately Orchestrates Metabolic And Immune Advantages in Hepatocellular Carcinoma
发表期刊：Advanced Science，2024IF=14.3
合作项目：非靶向代谢组学
合作单位：同济大学，上海交通大学
发表时间：2024.07
研究简介：肝细胞癌（HCC）是全球主要的癌症死亡原因之一，其细胞内尿苷核苷酸和脂肪酸代谢的显著激活促进了恶性增殖和免疫逃逸。研究发现，TRIM65（一种E3泛素-蛋白连接酶）在HCC中高表达，并通过O-GlcNAc糖基化修饰。TRIM65促进了代谢重塑，增加了与尿嘧啶代谢和棕榈酸相关的产物积累，从而推动了HCC的进展。在分子机制上，TRIM65介导了神经纤维瘤病2型（NF2）蛋白K44位点的泛素化，NF2是经典Hippo信号通路的关键上游蛋白。TRIM65加速NF2的降解，进而抑制了YAP1（yes-associated protein 1）的磷酸化，导致相关代谢酶转录的异常激活，并协调了代谢和免疫优势。揭示了TRIM家族分子TRIM65在支持HCC细胞存活中的关键作用，并强调了针对其E3连接酶活性进行靶向治疗以改变蛋白酶体降解调控的潜在治疗价值。
05. Prevotella copri exhausts intrinsic indole-3-pyruvic acid in the host to promote breast cancer progression: Inactivation of AMPK via UHRF1-mediated negative regulation
发表期刊：Gut Microbes，2024IF=12.2
合作项目：Q300＋个性化靶向
合作单位：佛山妇幼保健院
发表时间：2024.04
研究简介：该研究通过对乳腺癌患者与良性乳腺疾病结节患者的16S rRNA测序，分析了这两类人群肠道菌群的构成及其差异，构建小鼠乳腺癌模型，结合靶向代谢组学、蛋白质组学等多种技术手段，多角度深入研究了肠道菌群在乳腺癌起始与进展过程中的潜在作用机制。
二、消化系统类疾病
06. A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases
发表期刊：Cell，2024IF=45.5
合作项目：Q300全定量检测服务
合作单位：大连医科大学
发表时间：2024.05
研究简介：肠道真菌群落是人类健康的一个重要组成部分，但其功能和代谢潜力尚未得到充分阐述，这主要是因为可获得的参考基因组有限。该研究发布了肠道培养真菌（CGF）目录，包含了从健康个体粪便中获得的760个真菌基因组，涵盖了206个物种，跨越48个家族，其中包括69个之前未被识别的物种。探索了CGF物种的功能和代谢特性，并利用这一目录，通过分析来自中国和非中国人群的超过11,000个粪便宏基因组数据，构建了肠道真菌组的系统发育表示。此外，还确定了肠道真菌组组成中与常见疾病显著相关的变异，并通过动物实验验证了真菌特征与炎症性肠病（IBD）之间的关联，丰富了对人类肠道真菌组生物多样性和疾病相关性的理解。
07. Sensing of Liver-Derived Nicotinamide by Intestinal Group 2 Innate Lymphoid Cells Links Liver Cirrhosis and Ulcerative Colitis Susceptibility
发表期刊：Advanced Science，2024IF=14.3
合作项目：代谢流（13C6-glucose）技术检测服务
合作单位：山东大学
发表时间：2024.08
研究简介：通过代谢组学、单细胞转录组学、基因敲除和骨髓移植等技术手段，揭示了慢性肝病扰乱肝脏NAD+代谢，导致经肝-肠轴到达肠道的NAD+合成前体物NAM减少，损害肠道2型固有淋巴样细胞（ILC2s）的组织修复功能，继而在并发UC时加重疾病。
三、代谢性疾病
08. Statins aggravate insulin resistance through reduced blood glucagon-like peptide-1 levels in a microbiota-dependent manner
发表期刊：Cell Metabolism，2024IF=27.7
合作项目：胆汁酸谱靶向定量和非靶向代谢组学技术检测服务
合作单位：西安交通大学第一附属医院
发表时间：2024.02
研究简介：本研究揭示了他汀类药物通过降低肠道梭状芽孢杆菌，抑制CDCA向UDCA转化，引起肠道GLP-1分泌减少，从而导致机体糖代谢异常和胰岛素抵抗这一调控方式。同时，该研究的主要贡献还在于提出在他汀类药物广泛使用的现状下，UDCA的联合使用可能是一种不改变他汀降脂疗效同时降低糖耐量异常副作用的联合用药新手段。
09. Resistant starch intake facilitates weight loss in humans by reshaping the gut microbiota
发表期刊：Nature Metabolism，2024IF=18.9
合作项目：胆汁酸谱和Q200全定量检测服务
合作单位：上海六院
发表时间：2024.02
研究简介：本研究开展了一项随机双盲、交叉设计干预研究，通过精准的临床指标评估抗性淀粉干预对肥胖的缓解作用，同时进行多组学研究全面分析肠道微生物和代谢物的改变，探索抗性淀粉改善肥胖的机制，并对其中发挥作用的关键菌种进行了因果验证。
10. Ketogenic diet-induced bile acids protect against obesity through reduced calorie absorption
发表期刊：Nature Metabolism，2024IF=18.9
合作项目：胆汁酸谱定量和Q300全定量检测服务
合作单位：复旦大学
发表时间：2024.05
研究简介：通过自然人群队列研究、小鼠模型实验、代谢组学、宏基因组学、转录组学等技术手段，揭示了KD消耗降低体重和空腹血糖水平的独特宿主-肠道菌群代谢相互作用机制，发现两种胆汁酸TDCA和TUDCA作为除KD外治疗肥胖及其并发症的两种有希望的候选药物。
11. Mapping multi-omics characteristics related to short-term PM2.5 trajectory and their impact on type 2 diabetes in middle-aged and elderly adults in Southern China
发表期刊：Journal of Hazardous Materials，2024IF=12.2
合作项目： Q300全定量检测服务
合作单位：西湖大学
发表时间：2024.02
研究简介：大队列样本在生物标志物挖掘、疾病预测和流行病学研究中具有不可替代的作用，能够提供丰富的数据和信息，推动相关领域的研究和发展。本研究结合宏基因组学、蛋白质组学、代谢组学等方法，建立PM2.5短期暴露轨迹与多组学特征之间的联系，阐述PM2.5相关生物标志物与中国南方成年人中T2D的存在和发病率之间的关系。
12. Gut microbiota mediates ambient PM2.5 exposure-induced abnormal glucose metabolism via short-chain fatty acids
发表期刊：Journal of Hazardous Materials，2024IF=12.2
合作项目： 短链脂肪酸定量检测服务
合作单位：复旦大学
发表时间：2024.07
研究简介：肠道微生物群的生态失调促进代谢紊乱的易感性，如葡萄糖耐受不良和胰岛素抵抗，此外，肠道菌群所产生的代谢物对宿主生理也起到关键的作用。本研究通过宏基因组学、蛋白质组学、短链脂肪酸靶向测定等技术，阐述了肠道微生物群在PM2.5暴露诱导的糖代谢异常中起到介导作用，控制肠道微生物群或其代谢物是预防环境PM2.5对健康不利影响的潜在策略。
四、心血管疾病
13. Astrocytic LRP1 enables mitochondria transfer to neurons and mitigates brain ischemic stroke by suppressing ARF1 lactylation
发表期刊：Cell Metabolism，2024IF=27.7
合作项目：代谢流（13C6-glucose, 13C5-glutamine, 13C2-acetate）技术检测服务
合作单位：西南医科大学
发表时间：2024.06
研究简介：本研究揭示了星形胶质细胞中的LRP1通过抑制葡萄糖摄取、糖酵解和乳酸生成，导致ADP-核糖基化因子1 (ARF1)的乳酸化水平降低，进而促进了线粒体向受损神经元的转移，并缓解缺血导致的器官损伤。
14. Role of Argininosuccinate Synthase 1 -Dependent L-Arginine Biosynthesis in the Protective Effect of Endothelial Sirtuin 3 Against Atherosclerosis
发表期刊：Advanced Science，2024IF=14.3
合作项目：氨基酸谱定量检测服务
合作单位：香港中文大学
发表时间：2024.01
研究简介：本研究表明内皮细胞SIRT3缺失导致ASS1的高度乙酰化并失活，从而阻碍L-精氨酸合成途径。L-精氨酸水平的降低进而导致一氧化氮(NO)的合成减少，最终加速内皮功能障碍和动脉粥样硬化进展。这项研究为深入理解SIRT3在血管健康中的作用提供了新的视角，为动脉粥样硬化等疾病的治疗开发提供了潜在的靶点。
五、免疫类疾病
15. Cellular spermine targets JAK signaling to restrain cytokine-mediated autoimmunity
发表期刊：Immunity，2024IF=25.5
合作项目：多胺定量检测和非靶向代谢组学检测服务
合作单位：北京协和医学院基础医学研究所
发表时间：2024.06
研究简介：揭示了精胺能够抑制JAK介导的细胞因子免疫应答及炎症反应，有效缓解自身免疫性疾病进程。该研究还筛选出精胺天然衍生物SD1，证明了其具有广谱性免疫抑制和抗炎功能，表明精胺及其衍生物是细胞稳态的代谢检查点和控制自身免疫性疾病的潜在免疫抑制分子。
16. Diet-omics in the Study of Urban and Rural Crohn disease Evolution (SOURCE) cohort
发表期刊：Nature Communications，2024IF=14.7
合作项目：Q300全定量检测服务
合作单位：中山大学附属第一医院
发表时间：2024.05
研究简介：通过人口统计学、CD表型、生物标志物、食物频率调查问卷（FFQ）、国际IBD组织（IOIBD）制定的环境调查问卷、16S、宏基因组学、转录组学、代谢组学等方法研究城乡差异与CD发病的关系，揭示了饮食-菌群-宿主复杂的相互作用，确定与城乡转变和CD相关的潜在有益和致病因素。
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5. 脓毒症/ Acta Pharmaceutica Sinica B：Gut commensal metabolite rhamnose promotes macrophages phagocytosis by activating SLC12A4 and protects against sepsis in mice
6. 脑脊髓炎/ Microbiome：Dietary ellagic acid therapy for CNS autoimmunity: Targeting on Alloprevotella rava and propionate metabolism
7. 抑郁症/ Neuron：TGR5-mediated lateral hypothalamus-dCA3-dorsolateral septum circuit regulates depressive-like behavior in male mice
8. 胆管炎/ Gut Microbes：The fecal microbiota of patients with primary biliary cholangitis (PBC) causes PBC-like liver lesions in mice and exacerbates liver damage in a mouse model of PBC
9. 骨质疏松/ Cell Discovery：Multi-modal molecular determinants of clinically relevant osteoporosis subtypes
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