公开课回顾 | 肠道菌群及其代谢物参与肌卫星细胞稳态调控_肿瘤细胞_氨基酸代谢_非靶向代谢_脂质_多组学代谢流检测分析_脂肪酸定量

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公开课回顾 | 肠道菌群及其代谢物参与肌卫星细胞稳态调控

10月 30, 2023

随着我国经济社会的快速发展，应对人口老龄化已成为今后一段时间我国的基本国情。研究老年个体肌肉萎缩的病因和制定有效防治肌肉流失的干预措施，将有助于提高老年个体的生命质量，加快实现“健康老龄化”。近期，广东省科学院微生物研究所、华南应用微生物国家重点实验室谢黎炜研究员团队联合中国科学院亚热带农业生态研究所印遇龙院士团队在SCIENCE CHINA-Life Sciences期刊上发表了题为“Dynamic Changes in Butyrate Levels Regulate Satellite Cell Homeostasis by Preventing Spontaneous Activation During Aging”的研究。报道了肠道菌群可通过丁酸信号通路调控骨骼肌卫星细胞稳态及肌肉功能，该研究发现可为骨骼肌衰老的早期预防和干预提供新的干预靶点和预警方案。

9月21日19:00，麦特绘谱特邀此文一作南方医科大学附属第七医院——陈淑洁博士，作为本期绘谱学堂的主讲嘉宾，为大家带来《肠道菌群及其代谢物参与肌卫星细胞稳态调控》的报告分享，将从研究背景、科学假设、研究结果等方面分享科研背后的故事。欢迎各位老师入会听课，课后特设答疑环节，期待与您线上交流。

主讲嘉宾

陈淑洁，医学博士，南方医科大学附属第七医院博士后。主要围绕骨骼肌衰老与损伤修复、骨骼肌干细胞命运调控及肠道菌群开展研究工作，在SCIENCE CHINA-Life Sciences, The Innovation, Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle等学术期刊发表多篇论文。

技术问答

代谢组学数据处理——代谢通路分析

通过上述方法筛选到差异代谢物后，还需要挖掘和这些代谢物相关的代谢通路。此时，可以采用MetaboAnalyst网站(http://www.metaboanalyst.ca/)进行代谢通路分析（Metabolic pathway analysis），代谢通路分析分为富集分析（Enrichment analysis）和通路分析（pathway analysis）。通路分析中添加了通路拓扑分析（topology analysis），会输出通路在整体网络中的重要性（impact）。下图展示了典型的代谢通路分析图。

_{代谢通路分析展示图（来源：MetaboAnalyst网站）}

代谢组学数据处理——差异代谢物筛选

筛选差异代谢产物通常基于OPLS-DA模型，因为它更易于进行模型解释，所有跟分组相关的信息都集中于第一维。筛选的标准通常是基于以下两个指标：

Corr.Coeffs./p(corr) （Correlation Coefficient），是样本得分值t和变量X间的相关系数-Corr(t, X)，代表了变量的可靠度。该值没有固定阈值，通常设定对应的P值 < 0.05。
VIP （Variable importance in the projection），为变量对模型的重要性，描述了每一个变量对模型的总体贡献，通常设定阈值为VIP >1。

除此之外，基于单维检验的P值和变化倍数（Fold change）所作的火山图（Volcano plot）也是常用的筛选方法。