蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质，其原理是对固相载体进行特殊的化学处理，再将已知的蛋白分子产物固定其上（如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等），根据这些生物分子的特性，捕获能与之特异
性结合的待测物质（存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等），经洗涤、纯化，再进行确认和生化分析。
可应用于小分子靶点筛选、信号通路筛选、细胞因子检测、蛋白相互作用、疾病标志物筛选。相关技术有：HuProt 20K人类蛋白质组芯片、MPA细胞膜芯片技术、LUMINEX液相细胞因子芯片、Simoa超灵敏数字芯片。
